Rectores Magnificos

Rectores de la Real y Pontificia Universidad de San Carlos Borromeo

• Dr. José de Baños y Soto Mayor, arcediano de la Catedral, Predicador del Rey de España y Doctor de la Universidad de Osuna

• Antonio Larrazábal (1813, 1818-1821)

• Dr. Juan José de Aycinena y Piñol (1825-1829)

Rectores de la Academia de Ciencias

• Dr. Pedro Molina Mazariegos (1836-1840).

Rectores de la Pontificia Universidad de San Carlos Borromeo

• Obispo Juan José de Aycinena y Piñol, III Marqués de Aycinena (1840-1865)

Rectores de la Universidad Nacional

• Dr. Agustín Gómez

• Dr. Carlos Federico Mora (1944)

Rectores de la autónoma Universidad de San Carlos de Guatemala

• Dr. Carlos Federico Mora (1944-1945)

• Dr. Carlos Martínez Durán

• Dr. Mario Dary Rivera

• Dr. Edmundo Vásquez Martínez (1966-1970)

• Lic. Rafael Cuevas

• Lic. Saúl Osorio Paz (-14 de julio 1980)

• Ing. Roberto Molina Mejía (14 de julio de 1980-31 de julio de 1980)

• Dr. Eduardo Meyer Maldonado

• Lic. Roderico Segura

• Dr. Alfonso Fuentes Soria

• Ing. Efraín Medina

• Dr. Carlos Estuardo Gálvez Barrios

• Dr. Carlos Alvarado Cerezo